5° Curso Avanzado Usuarios NLHPC

En el marco de los cursos que estamos realizando para capacitar a nuestros usuarios actuales, así como a nuestros potenciales usuarios (véase este enlace para más información), se dictó nuestra quinta sesión de cursos avanzados para el uso de nuestra infraestructura. El curso fue dictado a través de la plataforma de streaming Zoom el día viernes 25 de junio de 09:00 a 13:00 (hora chilena).

Se recomienda haber asistido o revisado los contenidos del curso introductorio al uso de nuestro supercomputador antes de ver este taller. A partir de esos conocimientos se mostraron algunos conceptos más avanzados que permiten usar nuestra infraestructura de manera más eficiente.

Los contenidos revisados fueron los siguientes:

• Programación Paralela:
  • Modelo de Memoria compartida (OpenMP).
  • Modelo de Paso de mensajes (MPI).
• Ejecución de simulaciones:
  • Trabajos secuenciales.
  • Trabajos OpenMP.
  • Trabajos MPI.
  • Múltiples trabajos secuenciales (job array).
  • Trabajos que utilicen GPUs.
  • Dependencias de trabajos.
  • Programación de tareas usando crontab
• Monitoreo de simulaciones:
  • Monitoreando simulaciones utilizando htop.
  • Monitoreando simulaciones utilizando Ganglia.
  • Gráficas de utilización en correo de notificación.
• Instalación y compilación de aplicaciones:
  • Compiladores y flags utilizados.
  • Compilando programas desde el código fuente.
  • Instalación de módulos en Python.
  • Instalación de módulos en R.
• Problemas frecuentes:
  • Cancelación por exceso de memoria.
  • Cancelación por subutilización de CPU.
  • Cancelación por subutilización de Memoria.
  • Sobreutilización de recursos.

Para poder seguir el curso y los comandos ejecutados durante el taller, se recomienda tener conocimientos de Linux.

Pueden descargar la presentación que se utilizó durante la sesión, la cual contiene los ejercicios que se resolvieron durante el taller y ver a continuación el registro de esta actividad: