Introducción al NLHPC
Fecha: 16 de marzo 2022Hora de inicio: 18:00 hrs.
El objetivo del curso es mejorar la capacidad en Investigación Bioinformática en América Latina con énfasis en aplicaciones genómicas a la Biodiversidad, incluyendo Secuenciamiento y análisis de genomas, RNA-Seq y Metagenómica, mediante el trabajo en red conectados a un cluster de High Performance Computing (HPC) y el uso de técnicas modernas de capacitación.
La participación del NLHPC permitió presentar la infraestructura y el uso del Cluster Leftraru-Guacolda para el apoyo de las investigaciones científicas.
Los temas revisados en esta sesión tocaron los siguientes contenidos:
- Accediendo al cluster:
- Acceso vía SSH
- Recursos e Infraestructura disponible
- Gestor de recursos Slurm
- Qué es Slurm
- Parámetros utilizados
- Uso interactivo con srun
- Envío de tareas mediante sbatch
- Script básicos
- Encolar.
- Información y monitoreo de tareas
- Uso de comandos squeue y scontrol
- Acceso a nodos con tareas en ejecución
- Cancelación de tareas
- Subutilización de recursos.
- Otras tareas
- Sistema de módulos y Software
- Listado y búsqueda de software
- Uso del software disponible.
- Escalamiento de Aplicaciones.
Puedes ver a continuación el registro de esta charla en el siguiente vídeo: