Genética y Genómica de Poblaciones

Fecha: 14 de diciembre 2026
Hora de inicio: 09:30 hrs.

Te invitamos a postular a la 3.ª Edición del Curso Teórico-Práctico: Genética y Genómica de Poblaciones y sus Aplicaciones a la Evolución, Ecología y Conservación.

  • Lugar: Campus Fernando May, Universidad del Bío-Bío, Chillán
  • Fechas: 14 al 19 de diciembre de 2026 (09:30 – 18:00 hrs)
  • Modalidad: Presencial (asistencia obligatoria)
  • Dirigido a: Estudiantes de pregrado avanzado, postgrado (magíster y doctorado) e investigadores en biología, bioinformática y áreas afines
  • Costo: 100% Gratuito (Financiado por ANID SIA 85250178, ANID FOVI250067 y patrocinado por SOCEVOL)
  • Requisitos: Es deseable que los postulantes cuenten con conocimientos básicos en genética de poblaciones, manejo de línea de comandos y/o uso de R, y con datos genómicos o estén próximos a obtenerlos. Cada participante deberá disponer de un computador personal (Windows, macOS o Linux/Unix).
  • Cupos limitados
  • Postula en el siguiente enlace

Descripción

El curso tiene como objetivo que las y los participantes adquieran conocimientos teóricos y prácticos sobre los principales métodos de la genética y genómica de poblaciones y sus aplicaciones al estudio de procesos evolutivos, ecológicos y de conservación.
Está dirigido a estudiantes de pregrado avanzado, postgrado (magíster y doctorado) y personas dedicadas a la investigación en biología, bioinformática y disciplinas afines, interesadas en el análisis de datos de secuenciación de genomas completos (whole genome sequencing, WGS) y de técnicas de representación reducida del genoma.
En su tercera edición, el curso incluirá ejemplos de animales y plantas, abordando aplicaciones de la genómica al estudio de invasiones biológicas y de procesos evolutivos en especies nativas. Se trabajará tanto con variación genómica entre poblaciones como entre especies cercanas, explorando procesos de diversificación, adaptación y especiación.
Cada jornada combinará sesiones teóricas y talleres prácticos. Las sesiones prácticas se desarrollarán con el apoyo del Laboratorio Nacional de Computación de Alto Rendimiento (NLHPC), utilizando el supercomputador Guacolda-Leftraru Epu para ejecutar análisis en un entorno de computación de alto rendimiento (HPC).
Este curso es financiado por el proyecto ANID Subvención a la Instalación en la Academia, Convocatoria 2025 (ANID-SIA 85250178), ANID – Vinculación Internacional – FOVI250067, y patrocinado por la Sociedad Chilena de Evolución (SOCEVOL).

Programa del curso

Día 1: Entorno computacional, reproducibilidad y datos genómicos
Introducción a los recursos de computación de alto rendimiento (HPC): estructura y funcionamiento de servidores, gestión de tareas con SLURM, entornos y scripts. Buenas prácticas de eficiencia y reproducibilidad en investigación genómica. Recomendaciones para el uso de inteligencia artificial en la generación y revisión de scripts. Tipos de marcadores moleculares, tecnologías de secuenciación (genomas completos (WGS), representación reducida y lecturas cortas y largas) y relevancia de los genomas de referencia.
Taller práctico: Familiarización con la línea de comandos y editores de código. Creación y activación de entornos, instalación de herramientas básicas y ejecución de tareas en SLURM. Exploración de formatos de datos genómicos y descarga de datos públicos.
Día 2: Fundamentos de genética de poblaciones y procesamiento de datos genómicos
Conceptos básicos de genética de poblaciones y estrategias de obtención de datos.
Fundamentos del procesamiento de lecturas, alineamiento a genomas de referencia y llamado de variantes. Criterios de calidad y consideraciones para comparar poblaciones y especies cercanas.
Taller práctico: Evaluación de calidad, trimming, mapping, evaluación de cobertura y tratamiento de duplicados. Llamado de variantes, generación, filtrado y exploración de archivos VCF.
Día 3: Diversidad genética y estructura poblacional
Equilibrio de Hardy-Weinberg, teoría neutral, mutación, deriva génica y endogamia. Métricas de diversidad genética y diferenciación poblacional. Conceptos de FIS y FST y su interpretación biológica. Fundamentos del análisis de estructura poblacional y ancestría.
Taller práctico: Cálculo de métricas de diversidad y diferenciación genética. Estimación de estructura poblacional y exploración de patrones de ancestría en especies nativas e invasoras.
Día 4: Flujo genético, demografía y genómica de la invasión
Flujo génico y conectividad entre poblaciones. Conceptos de tamaño efectivo e inferencia de historia demográfica. Introducción a la genómica de la invasión y sus aplicaciones al estudio de rutas de introducción, mezcla poblacional y expansión.
Taller práctico: Inferencia de flujo génico y evaluación de señales de introgresión. Estimación de tamaño efectivo e historia demográfica. Interpretación de resultados en el contexto de invasiones biológicas y especies nativas.
Día 5: Selección, adaptación y asociación genotipo-ambiente
Selección natural, adaptación local y desequilibrio de ligamiento. Métodos de escaneo genómico para identificar loci y genes candidatos bajo selección. Fundamentos de las asociaciones genotipo-ambiente. Introducción al enriquecimiento funcional y categorías de ontología génica (GO). Aplicaciones en conservación y ecología molecular.
Taller práctico: Identificación de loci outliers, exploración de genes candidatos y análisis de asociación genotipo-ambiente. Introducción a la interpretación del enriquecimiento funcional y discusión integrada de evidencias de adaptación.
Día 6: Filogenómica y aproximaciones a la macroevolución
Fundamentos de inferencia filogenómica y relaciones evolutivas entre especies. Árboles de genes y árboles de especies: enfoques de concatenación y métodos basados en el coalescente. Discordancia genealógica y su relación con la separación incompleta de linajes, la hibridación y la introgresión. Uso de la información filogenómica para abordar preguntas sobre diversificación y especiación.
Taller práctico: Preparación y exploración de datos para análisis filogenómicos. Inferencia y comparación de relaciones entre especies cercanas e interpretación de discordancias entre genealogías. Integración de información genómica, ecológica y filogenética para la planificación de proyectos. Cierre del curso y discusión general.

Relatores

Dr. Moisés A. Valladares
 Biólogo evolutivo y académico de la Universidad del Bío-Bío.
Su investigación integra datos genómicos, fenotípicos y biogeográficos para comprender la diversificación y especiación, especialmente en organismos acuáticos, con énfasis en filogenética, sistemática y filogeografía. Actualmente lidera proyectos ANID orientados al estudio de la genómica de la especiación y al fortalecimiento de la investigación en biodiversidad, conservación y cambio global. Su experiencia incluye el estudio de la adaptación genómica de insectos plaga al cambio climático bajo un enfoque One Health, como investigador postdoctoral del Proyecto Anillo PIC 2 en la Universidad de Chile.


Dra. Pamela Morales
Licenciada en Ciencias Biológicas, y Magíster y Doctora en Ciencias con mención en Ecología y Biología Evolutiva.
Su línea de investigación se ha centrado en el estudio de la especiación y en comprender cómo se origina la biodiversidad. Para ello, ha integrado áreas de la genómica, biología evolutiva, genética de la conservación, especiación, ecología molecular y genética de poblaciones.
Actualmente, es postdoctorante en la Universidad del Bío-Bío (Chillán) e Investigadora Joven del Instituto Milenio Centro de Regulación del Genoma.

Dr. Paulo S. Zepeda
Doctor en Ciencias Biológicas con mención en Ecología por la Pontificia Universidad Católica de Chile. Actualmente es Director Ejecutivo de 1000 Genomas Chile, consorcio nacional que reúne a diez centros de excelencia ANID y cuyo objetivo es generar genomas de referencia para la biodiversidad chilena, en línea con los estándares del Earth BioGenome Project. Su formación se centra en la biología evolutiva y la genómica de poblaciones. En su tesis doctoral estudió la genómica de la invasión del roedor Rattus rattus en Sudamérica, integrando modelación demográfica, detección de señales de selección y modelos de distribución de especies. Actualmente, su trabajo combina la coordinación científica del consorcio con la articulación entre investigación, financiamiento y política pública en torno a la genómica de la biodiversidad.

Mag. Gabriela Narváez:
Biotecnóloga en plantas, con especialización en Genética y actualmente candidata a Doctora en Ciencias con mención en Ecología y Evolución en la Universidad Austral de Chile.
En su rol como investigadora doctoral en los Institutos Milenio CRG y BASE, aplica herramientas genómicas y bioinformáticas avanzadas al estudio evolutivo de la flora nativa sudamericana. Su investigación aborda la filogenómica, biogeografía y genética de la conservación en taxones clave como el género Nothofagus. Adicionalmente, participa activamente en proyectos de divulgación científica y monitoreo ciudadano para la conservación de orquídeas nativas de Chile, y forma parte del equipo directivo de la Red OWSD Chile (Organization for Women in Science for the Developing World).